南通背靠平原，三面环水，属于暖温带和亚热带的过渡气候，气候温和、四季分明，受海洋性气候影响较大，空气湿润，降水充沛。每年当中夏天炎热，冬季湿冷，唯有春秋两季天气适中，适合旅游。
春季春江水暖、百花盛开、莺啼燕舞；秋季晴朗凉爽，南通的市花——菊花也在此时开放，南通的许多公园都有菊花展览，此时到南通赏菊，看菊花的千姿百态、风高气节，也是一种难得的享受。
